Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms