Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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Ccdc18Q640L5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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