Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5dQ62240 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms