Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhocQ62159 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhocQ62159 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RhocQ62159 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms