Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms