Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HellsQ60848 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms