Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms