Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc27a1Q60714 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms