Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprnQ60673 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms