Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms