Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CttnQ60598 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CttnQ60598 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms