Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myh1Q5SX40 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms