Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp18Q5SSI6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms