Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eme2Q56A04 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms