Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms