Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pacs2Q3V3Q7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacs2Q3V3Q7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms