Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms