Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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D130052B06RikQ3UW13 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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D130052B06RikQ3UW13 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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D130052B06RikQ3UW13 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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D130052B06RikQ3UW13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
D130052B06RikQ3UW13 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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