Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Obox3Q3UT54 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms