Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms