Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms