Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms