Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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