Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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