Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms