Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms