Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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