Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Cers3Q1A3B0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cers3Q1A3B0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cers3Q1A3B0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms