Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rpusd3Q14AI6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rpusd3Q14AI6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rpusd3Q14AI6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rpusd3Q14AI6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rpusd3Q14AI6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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