Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Spatc1Q148B6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Spatc1Q148B6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Spatc1Q148B6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Spatc1Q148B6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Spatc1Q148B6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms