Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms