Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms