Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cntn3Q07409 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms