Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms