Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfiaQ02780 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfiaQ02780 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms