Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms