Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
GscQ02591 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms