Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja5Q01231 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms