Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nbr1P97432 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nbr1P97432 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms