Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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