Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frat1P70339 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms