Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms