Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps29P62274 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps29P62274 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms