Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms