Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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