Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mmp20P57748 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mmp20P57748 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mmp20P57748 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mmp20P57748 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp20P57748 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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