Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sept1P42209 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms