Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms