Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprkP35822 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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PtprkP35822 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprkP35822 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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