Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprmP28828 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtprmP28828 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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